Das Flickwerkforschungszentrum (ツギハギ研究所, Tsugihagi Kenkyuujo) ist das Labor und das Haus von Doktor Stein. Außerhalb stehen einige Bäume, die Pfeile anstatt Äste haben. Im inneren befindet sich Steins Computer und am Boden befinden ebenfalls Pfeile. Am ganzen Gebäude befinden sich Narben, Steins Markenzeichen neben seiner Schraube am Kopf. Man findet dort auch viele Vögel und Mäuse, welche auch dem Thema der Narben folgen.